為強化內部控制機制，本總處於105年1月7日以主綜督字第1050600013號函修訂「主計業務內部控制制度共通性作業範例」，其中內部審核作業部分（編號DQ07-DQ22），除參酌以往違失案例、配合法規異動與實務運作流程等檢修作業程序說明及控制重點外，並將旨揭手冊作業整併納入，爰停止適用旨揭手冊，各機關處理內部審核作業請參採上開共通性作業範例（已登載於本總處網站http://www.dgbas.gov.tw政府內部控制專區）。